Havo harakatiga xizmat ko‘rsatish va parvozlarni radiotexnika ta’minlash sohasida “O‘zaeronavigatsiya” Markazi quyidagi tashkilotlar bilan o‘zaro hamkorlik qiladi:

• Xalqaro fuqaro aviatsiyasi tashkiloti (ICAO) - Birlashgan Millatlar Tashkilotining ixtisoslashgan muassasasi boʻlib, fuqaro aviatsiyasi uchun xalqaro standartlarni belgilaydi va xavfsizlik va samaradorlikni oshirish maqsadida uning rivojlanishini muvofiqlashtiradi. 
• Xalqaro havo transporti assotsiatsiyasi (IATA) - dunyo isteʼmolchilari manfaati uchun xavfsiz, ishonchli va tejamkor havo qatnovini targʻib qilish uchun aviakompaniyalar oʻrtasidagi hamkorlikning asosiy mexanizmi hisoblanadi.
• Xalqaro elektraloqa ittifoqi (XEI) - telekommunikatsiya va radioaloqa sohasidagi tavsiyalarni belgilaydigan, shuningdek, radiochastotalardan xalqaro foydalanishni tartibga soluvchi xalqaro tashkilotdir.
• Eurocontrol (EUROCONTROL) - aeronavigatsiya xavfsizligi boʻyicha Yevropa tashkiloti boʻlib, Yagona Yevropa osmoni loyihasi doirasida havo harakatini boshqarishning Umumevropa tizimini ishlab chiqish maqsadida tashkil etilgan.
• Davlatlararo Aviatsiya Qoʻmitasi (IAK) - 12 ta yangi mustaqil davlat tomonidan tuzilgan Fuqaro aviatsiyasi va havo hududidan foydalanish toʻgʻrisidagi davlatlararo shartnoma asosida yagona aviatsiya qoidalarini, parvozga yaroqlilik standartlarini, aviatsiyani sertifikatlashtirishning yagona tizimini taʼminlash maqsadida tashkil etilgan kengashidir. Uning faoliyati uskunalar va uni ishlab chiqarish, xalqaro toifadagi aerodromlar va ularni jihozlash, aviatsiya hodisalarini mustaqil tekshirish, fuqaro aviatsiyasini rivojlantirish masalalarini muvofiqlashtirish va havo harakatini boshqarish tizimlarini rivojlantirish milliy dasturlarini muvofiqlashtirishdan iborat.
• Yevroosiyo Muvofiqlashtiruvchi Kengashi - 1999-yilda tashkil etilgan ishtirokchi davlatlar kengashi boʻlib, uning maqsadi qoʻshni davlatlarning ATM/ATFM organlari oʻrtasidagi muammolarni hal qilishda samaradorlikni oshirish, milliy aviatsiya maʼmuriyatlari uchun aviatsiya sohasida davlat tomonidan tartibga solish boʻyicha kelishilgan takliflarni ishlab chiqishdan iborat havo harakatini boshqarish. Kengashning doimiy aʼzolari: Ozarbayjon, Armaniston, Belarus, Qozogʻiston, Qirgʻiziston, Rossiya, Tojikiston, Oʻzbekiston.